Setelah diselamatkan oleh Nox, Baku didesak untuk mengungkapkan lokasi markas CODE, yang dilihatnya dalam mimpi kenabian. Tampaknya Nox berniat menyerbu markas CODE...
Setelah melalui banyak pergumulan batin, Baku juga bertekad untuk menghancurkan perangkat aktivasi Code: Somnia. Nox berkonflik dengan Three, sementara Baku berhadapan dengan Five dan merebut kembali dunia dari CODE!
Dalam misi ini, Baku dan Nem bergabung dengan Badan Penanggulangan Kaiju. Harapan umat manusia melawan kaiju ganas terletak pada robot raksasa CODE Zeroider! Kamen Rider Zeztz, yang kini berukuran Ultra-besar, turun untuk menyelamatkan pilot yang dalam keadaan genting!
Saat Baku terbangun dari mimpi buruk, dunia nyata telah berubah total. Bertekad untuk mengungkap kebenaran, Baku kembali ke dunia mimpi, hanya untuk menemukan bahwa Nem menjadi sasaran Six. Saat Baku berjuang untuk melindungi Nem, Three muncul dan menunjukkan kekuatan yang mengerikan...!?
